Апрелевское отделение ВНИГНИ создано 20.05.75 г. на базе центрального кернохранилища эталонных образцов керна, экспериментальной буровой установки БУ-125 Э, секторов методики региональных работ и бурения поисковых и разведочных скважин на нефть и газ.

Первым заведующем отделением был назначен В.Я.Широков (1975-1977 гг.), в 1977-1986 гг. отделением заведовал И.Д. Симоненков, а с 1986 г. директором отделения является А.А. Русаев, Большой вклад в создание и развитие отделения внес заместитель директора ВНИГНИ A.T.Ш марев.

Основные направления научно-исследовательской деятельности отделения - разработка и внедрение новых методов и технологий бурения, крепления глубоких скважин, методов синтеза, технологии производства и применения экологически безопасных химических реагентов для обработки буровых и тампонажных растворов, обеспечивающих повышение механической и коммерческой скоростей бурения в сложных горно-геологических условиях нефтегазоносных районов, выбор и экспериментальная проверка новых технических средств для их осуществления на опытной буровой установке БУ-125 Э с дальнейшим испытанием и внедрением на предприятиях отрасли; разработка комплекса методов, технических средств и технологических приемов вскрытия пластов, опробования, испытания и исследования продуктивных объектов; создание АИС "Керн" для обобщения. анализа и комплексной обработки результатов региональных геолого-геофизических работ, разработка методики и составление по материалам опорного и параметрического бурения литолого-генетических типов разрезов основных нефтегазоносных провинций, создание "Федерального фонда кернового материала, палеонтологических и литологических коллекций и коллекций нефтей нефтегазононых провинций России"; разработка нормативной документации по охране окружающей среды при производстве геолого-разведочных работ на нефть и газ.